MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xenorhabdus bovienii SS-2004 chromosome

Total Repeats: 84552

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013892	TC	3	6	4	9	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013892	GAT	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013892	TCA	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013892	GGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013892	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013892	TTA	2	6	130	135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013892	GCA	2	6	176	181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473095
8	NC_013892	CT	3	6	274	279	0 %	50 %	0 %	50 %	290473095
9	NC_013892	AG	3	6	312	317	50 %	0 %	50 %	0 %	290473095
10	NC_013892	AT	3	6	320	325	50 %	50 %	0 %	0 %	290473095
11	NC_013892	TTA	2	6	342	347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
12	NC_013892	TAA	2	6	395	400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473095
13	NC_013892	CCAG	2	8	509	516	25 %	0 %	25 %	50 %	290473095
14	NC_013892	TTG	2	6	565	570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473095
15	NC_013892	GGC	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473095
16	NC_013892	CAT	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473095
17	NC_013892	GC	3	6	714	719	0 %	0 %	50 %	50 %	290473095
18	NC_013892	AGA	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
19	NC_013892	TTA	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
20	NC_013892	CTG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473095
21	NC_013892	GAT	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473095
22	NC_013892	T	6	6	858	863	0 %	100 %	0 %	0 %	290473095
23	NC_013892	AAG	2	6	883	888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
24	NC_013892	CTG	2	6	912	917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473095
25	NC_013892	ATT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
26	NC_013892	GAA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
27	NC_013892	CTTT	2	8	1108	1115	0 %	75 %	0 %	25 %	290473095
28	NC_013892	CGCCAA	2	12	1175	1186	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	290473095
29	NC_013892	CGGG	2	8	1193	1200	0 %	0 %	75 %	25 %	290473095
30	NC_013892	TTA	2	6	1239	1244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473095
31	NC_013892	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473095
32	NC_013892	GCCC	2	8	1353	1360	0 %	0 %	25 %	75 %	290473095
33	NC_013892	TGG	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473095
34	NC_013892	ACA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473095
35	NC_013892	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473095
36	NC_013892	AGA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473095
37	NC_013892	ATT	2	6	1578	1583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473096
38	NC_013892	CAG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
39	NC_013892	AGC	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
40	NC_013892	GCC	2	6	1619	1624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473096
41	NC_013892	TTG	3	9	1648	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473096
42	NC_013892	GAAATG	2	12	1699	1710	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290473096
43	NC_013892	CAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473096
44	NC_013892	T	6	6	1774	1779	0 %	100 %	0 %	0 %	290473096
45	NC_013892	CGGA	2	8	1799	1806	25 %	0 %	50 %	25 %	290473096
46	NC_013892	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473096
47	NC_013892	GAA	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473096
48	NC_013892	ATTGA	2	10	2152	2161	40 %	40 %	20 %	0 %	290473096
49	NC_013892	GCT	2	6	2166	2171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473096
50	NC_013892	GGC	2	6	2176	2181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473096
51	NC_013892	CTG	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473096
52	NC_013892	GCA	2	6	2207	2212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473096
53	NC_013892	CG	3	6	2221	2226	0 %	0 %	50 %	50 %	290473096
54	NC_013892	CCG	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473096
55	NC_013892	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473096
56	NC_013892	GTG	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473096
57	NC_013892	AAC	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473096
58	NC_013892	GAA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473096
59	NC_013892	TC	3	6	2676	2681	0 %	50 %	0 %	50 %	290473097
60	NC_013892	GGGC	2	8	2815	2822	0 %	0 %	75 %	25 %	290473097
61	NC_013892	GCA	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473097
62	NC_013892	GAA	2	6	2866	2871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473097
63	NC_013892	TTC	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473097
64	NC_013892	GGC	2	6	2885	2890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473097
65	NC_013892	TGC	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
66	NC_013892	GCT	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
67	NC_013892	CCG	2	6	3069	3074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473097
68	NC_013892	GCT	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
69	NC_013892	T	7	7	3114	3120	0 %	100 %	0 %	0 %	290473097
70	NC_013892	GCT	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473097
71	NC_013892	GCG	2	6	3163	3168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473097
72	NC_013892	CAG	2	6	3337	3342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473097
73	NC_013892	AG	3	6	3354	3359	50 %	0 %	50 %	0 %	290473097
74	NC_013892	CG	3	6	3378	3383	0 %	0 %	50 %	50 %	290473097
75	NC_013892	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473097
76	NC_013892	TGA	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473097
77	NC_013892	GCCG	2	8	3604	3611	0 %	0 %	50 %	50 %	290473097
78	NC_013892	TGAT	2	8	3695	3702	25 %	50 %	25 %	0 %	290473097
79	NC_013892	CTC	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290473098
80	NC_013892	CCGT	2	8	3833	3840	0 %	25 %	25 %	50 %	290473098
81	NC_013892	GAT	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
82	NC_013892	CAC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
83	NC_013892	GTT	2	6	3907	3912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
84	NC_013892	CGA	2	6	3924	3929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
85	NC_013892	CCAT	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	290473098
86	NC_013892	GAT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
87	NC_013892	GAA	3	9	4030	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
88	NC_013892	CAG	2	6	4046	4051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
89	NC_013892	TCA	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473098
90	NC_013892	TGC	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
91	NC_013892	G	6	6	4080	4085	0 %	0 %	100 %	0 %	290473098
92	NC_013892	GGT	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
93	NC_013892	TGT	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
94	NC_013892	AGA	2	6	4416	4421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
95	NC_013892	GGT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
96	NC_013892	TTG	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
97	NC_013892	TCT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473098
98	NC_013892	CAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473098
99	NC_013892	TGGT	2	8	4625	4632	0 %	50 %	50 %	0 %	290473098
100	NC_013892	ACA	2	6	4685	4690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473098
101	NC_013892	A	6	6	4690	4695	100 %	0 %	0 %	0 %	290473098
102	NC_013892	TGA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
103	NC_013892	TCT	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473098
104	NC_013892	ATGA	2	8	4837	4844	50 %	25 %	25 %	0 %	290473098
105	NC_013892	CTG	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
106	NC_013892	GTC	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
107	NC_013892	AGC	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
108	NC_013892	CGC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
109	NC_013892	TGG	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473098
110	NC_013892	TGT	2	6	5162	5167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473098
111	NC_013892	TGA	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
112	NC_013892	ATC	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473098
113	NC_013892	CTG	3	9	5305	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473098
114	NC_013892	A	6	6	5392	5397	100 %	0 %	0 %	0 %	290473098
115	NC_013892	TC	3	6	5473	5478	0 %	50 %	0 %	50 %	290473098
116	NC_013892	AAT	2	6	5599	5604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473098
117	NC_013892	ACC	2	6	5612	5617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
118	NC_013892	GAA	2	6	5659	5664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
119	NC_013892	GCA	2	6	5711	5716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473098
120	NC_013892	GATTTC	2	12	5812	5823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290473098
121	NC_013892	CCG	2	6	5841	5846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
122	NC_013892	ATTG	2	8	5865	5872	25 %	50 %	25 %	0 %	290473098
123	NC_013892	GAA	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473098
124	NC_013892	CCG	2	6	5970	5975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473098
125	NC_013892	TCCA	2	8	5983	5990	25 %	25 %	0 %	50 %	290473098
126	NC_013892	ACC	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473098
127	NC_013892	ATG	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473098
128	NC_013892	TAA	2	6	6193	6198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473098
129	NC_013892	CTT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013892	A	6	6	6328	6333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013892	ATA	3	9	6392	6400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013892	TAA	3	9	6403	6411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013892	CAA	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473099
134	NC_013892	TATAAA	2	12	6578	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473099
135	NC_013892	ATTA	2	8	6605	6612	50 %	50 %	0 %	0 %	290473099
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139	NC_013892	TAT	2	6	6690	6695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473100
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401	NC_013892	CGA	2	6	18320	18325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473110
402	NC_013892	CTC	2	6	18425	18430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290473110
403	NC_013892	ACC	2	6	18463	18468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473110
404	NC_013892	TTG	2	6	18655	18660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473111
405	NC_013892	TTC	2	6	18680	18685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
406	NC_013892	TTG	2	6	18710	18715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290473111
407	NC_013892	CCA	3	9	18775	18783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473111
408	NC_013892	TCA	3	9	18795	18803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
409	NC_013892	T	6	6	18854	18859	0 %	100 %	0 %	0 %	290473111
410	NC_013892	T	6	6	18866	18871	0 %	100 %	0 %	0 %	290473111
411	NC_013892	T	6	6	18919	18924	0 %	100 %	0 %	0 %	290473111
412	NC_013892	CAT	2	6	18997	19002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
413	NC_013892	CAG	2	6	19004	19009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473111
414	NC_013892	CAT	2	6	19012	19017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
415	NC_013892	CGC	2	6	19018	19023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290473111
416	NC_013892	TTC	2	6	19028	19033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
417	NC_013892	CTG	2	6	19097	19102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473111
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422	NC_013892	CAT	2	6	19270	19275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
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424	NC_013892	TACT	2	8	19323	19330	25 %	50 %	0 %	25 %	290473111
425	NC_013892	AATA	2	8	19359	19366	75 %	25 %	0 %	0 %	290473111
426	NC_013892	CCA	2	6	19525	19530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473111
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428	NC_013892	C	6	6	19634	19639	0 %	0 %	0 %	100 %	290473111
429	NC_013892	ACT	2	6	19679	19684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
430	NC_013892	TTA	2	6	19827	19832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473111
431	NC_013892	CAG	2	6	19912	19917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290473111
432	NC_013892	AAT	2	6	19943	19948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
433	NC_013892	AAT	2	6	19994	19999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
434	NC_013892	TGG	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290473111
435	NC_013892	CCAA	2	8	20168	20175	50 %	0 %	0 %	50 %	290473111
436	NC_013892	TCT	2	6	20190	20195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
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439	NC_013892	ATC	2	6	20279	20284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
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444	NC_013892	TCA	2	6	20430	20435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
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447	NC_013892	ATC	2	6	20630	20635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
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449	NC_013892	ATT	2	6	20648	20653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473111
450	NC_013892	GA	3	6	20655	20660	50 %	0 %	50 %	0 %	290473111
451	NC_013892	ATC	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
452	NC_013892	TTC	2	6	20729	20734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290473111
453	NC_013892	TCA	2	6	20778	20783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
454	NC_013892	T	6	6	20825	20830	0 %	100 %	0 %	0 %	290473111
455	NC_013892	ATC	2	6	20849	20854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473111
456	NC_013892	AAT	2	6	20879	20884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290473111
457	NC_013892	CTGG	2	8	20957	20964	0 %	25 %	50 %	25 %	290473111
458	NC_013892	GTTC	2	8	21016	21023	0 %	50 %	25 %	25 %	290473111
459	NC_013892	GAG	2	6	21038	21043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
460	NC_013892	CTT	2	6	21051	21056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_013892	AAT	2	6	21083	21088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_013892	ATT	2	6	21119	21124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_013892	ATT	2	6	21250	21255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290473112
464	NC_013892	ATC	2	6	21267	21272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
465	NC_013892	GGC	2	6	21327	21332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290473112
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467	NC_013892	T	6	6	21357	21362	0 %	100 %	0 %	0 %	290473112
468	NC_013892	TCAACT	2	12	21382	21393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
469	NC_013892	A	7	7	21416	21422	100 %	0 %	0 %	0 %	290473112
470	NC_013892	TGC	2	6	21460	21465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290473112
471	NC_013892	ACT	2	6	21498	21503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
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473	NC_013892	CAA	2	6	21585	21590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473112
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479	NC_013892	ACC	2	6	21882	21887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290473112
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485	NC_013892	TCA	2	6	22174	22179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290473112
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489	NC_013892	TAT	2	6	22426	22431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013892	GAT	2	6	22438	22443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013892	AAT	2	6	22543	22548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_013892	A	6	6	22553	22558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_013892	AT	5	10	22580	22589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013892	T	7	7	22589	22595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_013892	CATC	2	8	22632	22639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
496	NC_013892	A	6	6	22654	22659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013892	A	7	7	22664	22670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013892	ACA	2	6	22831	22836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290473113
499	NC_013892	AGA	2	6	22855	22860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290473113
500	NC_013892	GAT	2	6	22895	22900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290473113

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